前4年
主要科目：

• 《入菩薩行論》(寂天菩薩)
• 《解脫莊嚴寶論》(岡波巴大師)
• 《一意》(「Gongchig」，吉天頌恭祖師)
• 《量論》(「邏輯或推理」)。在前兩年中為附設科目，由不同的上師傳授《量論》的基本課程。第三年時，《量論》成為以《釋量論》(法稱菩薩)為教本的主修課程
• 《根本中觀頌》(龍樹菩薩)
• 《入中論》(月稱菩薩)
• 《四百論》(聖天菩薩)，以及其他法稱菩薩和清辨菩薩的著作。

附設科目：

• 噶舉派與直貢噶舉傳承歷史
• 英語
• 藏語文法

在4年的學習結束時，學生們將獲得《中觀論》哲學研究的證書。

接下來的3年
主要科目：

• 《毘曇學》(「顯現佛法」):《阿毗達磨俱舍論》(世親菩薩)和《大乘阿毘達磨集論》(無著菩薩)
• 《般若波羅蜜多》(「智慧之圓滿」)：《彌勒五論》(1.現觀莊嚴論，2.大乘莊嚴經論，3.辨法法性論，4.辨中邊論，5.究竟一乘寶性論)
• 《一意》(「Gongchig」，吉天頌恭祖師)

附設科目：

• 詩學
• 英語
• 藏語文法

在結束3年的修習後，學僧們將獲得滇秋(Tencho)或沙斯特里(Shastri)的學位。

最後2年
主要科目：

• 律(「僧侶行為規範」)：《律經》(德光論師)及《戒經》
• 密續教法集：由　達波塔西南賈(Dakpo Tashi Namgyal)所著之《三光疏》

兩年期屆，學僧們將獲得洛彭(Lopon)或阿闍黎(Acharya)的學位。學士後研究不同支派的佛教哲學，將授予堪布之銜稱。

學科測驗

學生必須參加兩年一度和一年一度的學科測驗。若學生缺考，或是無法全部通過這兩場測驗，就必須重讀課程。

凡參加學科測驗者，在兩年一度和一年一度測驗前，主科課程不可缺席超過12次，除非此學生身攬重要的官方事務，或患重大疾病。

學科測驗理事委員會將於測驗實施前一個月公佈測驗日程表。委員會必須確保測驗卷內容絕對保密，若是在印刷過程中有任何外洩情節，測驗理事委員會必須另準備新試卷。

學生不得攜帶任何書籍或本文進入考場。若考生有舞弊之實，則必須停止測驗，或接受當科分數扣10分的懲罰。

若連續兩次測驗皆不及格，學生將無法繼續在佛學院就讀。

假期規定

暑假期間固定為藏曆4月10日至6月10日，約為西曆5、6月之時。暑假結束，學生必須準時返回佛學院。