桑丹林尼姑寺院分為學校/學院及寺院，這是為了讓有些較年長，和對學習學院的課程感到有困難的新進的尼姑們，能夠有機會接受適當的教育。

寺院中的尼姑們，早上參加與其他的尼姑們相同的佛法課程，但是藏語、英語、數學及通識課程是分開的。下午，則是在尼姑寺院參加應請求的祈禱，並且於稍後加入尼姑團，以進行寺院中更多例行的祈禱活動。尼姑們也應外來的大眾的請求，為他們的朋友和所愛之人作祈禱。有時當老師有空的時候，尼姑們也學習儀式和儀軌，例如供養和宗教音樂。

寺院針對新進的尼姑們，提供Ka及Kha的基礎課程。其餘尼姑們則參加和噶舉佛學院的僧侶們一樣的課程，由以下所組成：

初級課程：佛法課程、藏語、文學及辯證
Uma課程：四年的佛法課程、藏語、文學及辯證
Thenchö課程：三年的上述課程
Lopön課程：兩年的佛法研讀
每週日於佛法課程結束後，尼姑們可自行選擇參加一個半小時所謂的星期天社團。目前星期天社團有電腦、中文、北印度語、美術、儀軌。

2008年從噶舉佛學院畢業的兩位僧侶─甘滇津諾布(Gen Tenzin Norbu)和陳模蘭 (Ghen Monlam)，目前教導尼姑們佛法及藏語。並由甘次洛(Gen Tselo)在藏語課程方面協助這些老師。來自色拉杰寺的格西滇津卻扎 (Geshe Tenzin Choedrak)也剛加入桑丹林尼姑寺院，擔任辯論老師。諾金夏格巴(Norzin Shakabpa)女士負責教英文，次仁玉珍(Tsering Yudon)女士教數學及社會課程，次仁旺姆尼姑(Nun Tsering Wangmo)則負責教僧院中的尼姑們英文和數學，同時也擔任保健人員。下午是尼姑寺院的打掃時間。星期一放假。